С его именем связаны победы СССР над эпидемиями тифа, менингита и холеры, и борьба с эпидемией ВИЧ. Его считают одним из основателей отечественной школы инфекционистов и эпидемиологов, разработавшим уникальные диагностические системы, которые используют во всем мире по сей день. На счету ученого больше 700 научных работ.
Окончив школу в подмосковном поселке Клязьма, Валентин Покровский подал документы в Сеченовский университет.
В 1955 году Покровский защитил кандидатскую диссертацию по теме «Клиническое течение брюшного тифа и состояние некоторых защитных функций организма при лечении синтомицином».
С 1965 по 1987 годы В.И. Покровский заведовал курсом, а затем и кафедрой инфекционных болезней Московского медицинского стоматологического института имени Н. А. Семашко (ныне им. А. И. Евдокимова).
По линии Минздрава СССР В.И. Покровского назначили главным внештатным инфекционистом и заместителем директора Центрального научно-исследовательского института эпидемиологии.
В начале 70-х годов в СССР разразилась эпидемия менингококковой инфекции. На борьбу с эпидемией были направлены бригады инфекционистов под руководством В.И. Покровского. Ученый первым в мире предложил революционное решение: применять массивные дозы пенициллина, вводя его внутримышечно, а позднее - и внутривенно. После ликвидации очагов эпидемии В.И. Покровский опубликовал итоговые результаты исследований и лечения бактериального гнойного менингита в многочисленных статьях и в отдельной фундаментальной работе «Менингококковая инфекция».
Вспышка холеры в Астрахани.
Холера оставалась одной из самых опасных инфекционных болезней до середины XX века. В 1970 году пандемия холеры, от которой умирали 30 % зараженных, достигла южных регионов СССР. Заболевание вселяло страх не только в обычных граждан, но и в самих медиков, которые даже в 40-градусную жару не снимали противочумные костюмы.
Покровский возглавил группу ученых-клиницистов и врачей и отправился в эпицентр событий. «Когда мы туда прилетели и пришли в больницу, меня просто ошарашил вид медперсонала: все в противочумных костюмах, масках, сапогах - и это при температуре 40 градусов в тени», - вспоминал ученый. «И тогда, может быть, немного бравируя, мы пошли к пациентам в чем были. Я сел на постель больного, хотя так делать не положено, но тогда нужно было сделать именно так».
Своим поступком ученый хотел сломать синдром страха врачей перед инфекцией, и ему это удалось. В.И. Покровский первым разработал новую клиническую классификацию холеры на основе оценки степени дегидратации. Она позволила оказывать неотложную помощь даже в полевых условиях, а главное - снизить летальность эпидемии до единичных случаев.
В 80-х годах прошлого века, когда началась эпидемия вируса иммунодефицита человека, Валентин Покровский организовал службу по диагностике и профилактике ВИЧ-инфекции. Он диагностировал первые случаи заболевания в стране, создал сеть лабораторий по выявлению больных, наладил их учет, разработал противоэпидемические мероприятия, высказал научно обоснованные предположения о возможности распространения ВИЧ-инфекции в стране. Под его руководством Минздравом России была создана и утверждена концепция профилактики внутрибольничных инфекций.
С 1971 года В.И. Покровский почти полвека возглавлял Центральный научно-исследовательский институт эпидемиологии Роспотребнадзора.
В последние годы он занимал в институте пост советника директора по инновациям.

